K nehodě došlo tak, že sedmačtyřicetiletý řidič škodovky jel po ulici Říční ve směru od Vrahovic na Držovice a na železničním přejezdu nerespektoval červené světlo zabezpečovacího zařízení, vjel na železniční přejezd v době, kdy zprava ve směru od Olomouce na Prostějov jel uvedený rychlík. Následkem toho se střetla lokomotiva pravou přední částí s pravou zadní části automobilu. Po střetu bylo auto odhozeno vlevo mimo komunikaci.
Nehoda se naštěstí obešla bez zranění. Ve vlaku přitom cestovalo 35 cestujících, kteří byli po nehodě za doprovodu hasičů odvedeni na vlakové nádraží. Dechové zkoušky ukázaly, že ani řidič, ani strojvedoucí nepožili před jízdou alkohol.
Na místě byli přítomni pracovníci Správy železnic a Správy sdělovací a zabezpečovací techniky Olomouc, kteří neshledali závadu na zabezpečovacím zařízení.
Na trati byla po nehodě v době od 6:15 do 8:15 výluka. Při dopravní nehodě vznikla hmotná škoda na osobním vozidle v předběžně odhadnuté výši 600 tisíc korun a na lokomotivě cca 100 tisíc korun. Dopravní nehoda byla vyřešena v příkazním řízení uložením blokové pokuty v částce 5000 korun.